Actualités des bio-industries
Grenoble - Rhône-Alpes :

IBS - UVHCI : des chercheurs rendent accessible un nouveau pan de la génomique structurale

Des chercheurs grenoblois de l'Institut de biologie structurale (IBS -CNRS/CEA/UJF) et de l'UVHCI1 (CNRS/EMBL/UJF) viennent de développer une approche rendant enfin accessible une nouvelle partie du génome humain aux études structurales.

En effet, près de 40 % des protéines sont caractérisées par une structure intrinsèquement désordonnée qui n’autorise pas leur étude par les techniques classiques de biologie structurale. En réussissant à caractériser les propriétés structurales d’une de ces protéines par une technique innovante de résonance magnétique nucléaire, ces chercheurs ont relevé un défi majeur de la génomique structurale actuelle. Grâce à cette avancée, il sera désormais possible de comprendre les relations entre la structure et la fonction de ces protéines intrinsèquement désordonnées qui jouent un rôle clé dans de nombreuses pathologies humaines. Ces travaux ont été publiés le 11 janvier online par la revue Journal of American Chemical Society...

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IBS : La biologie structurale de Grenoble distinguée par le CNRS

Jérôme Boisbouvier, chargé de recherche, et Jacques Joly, ingénieur de recherche, sont lauréats respectivement de la Médaille de bronze et du Cristal du CNRS. Ils travaillent à l’Institut de biologie structurale (IBS - CNRS/CEA/UJF), une des unités les plus en pointe de la recherche en biologie.

Spécialiste de l’étude structurale des macromolécules biologiques, Jérôme Boisbouvier travaille sur divers sujets de santé tels que l’hépatite C, le cancer ou encore le sida. Pour étudier ces grandes molécules du vivant telles que les assemblages de protéines, Jérôme Boisbouvier et son équipe ont développé une nouvelle technique d’observation, qui permet de comprendre le plus finement possible les biomolécules observées.
Les chercheurs de l’équipe de Jérôme Boisbouvier ont réussi à combiner trois techniques d’observation communément utilisées, et ainsi, à réduire à près d’une seconde le temps expérimental requis pour sonder par RMN des assemblages biomoléculaires de grandes tailles. Une grande avancée en biologie structurale !Cette technique nouvelle est opérationnelle nulle part ailleurs.

Membre du groupe « Synchrotron » du laboratoire de cristallographie et cristallogenèse des protéines de l’IBS, Jacques Joly participe depuis l’origine aux développements de la « Ligne de lumière FIP », une source de rayons X extrêmement puissante que l’ESRF (European synchrotron radiation facility) met à disposition de la communauté scientifique internationale. Dédiée aux expériences de diffraction de macromolécules biologiques, cette ligne de lumière est équipée des matériels et logiciels nécessaires à ces techniques : détecteurs de rayons X, diffractomètres, systèmes de vide, cryogénie, robots… .
Le travail de Jacques Joly consiste, avec son équipe, à implanter les matériels nécessaires aux expériences qui sont disposées au bout des lignes de lumière, et à développer les logiciels permettant de les piloter.
Le souci permanent de l’équipe de Jacques Joly : simplifier les manipulations et les rendre accessibles en continu. « Les scientifiques qui viennent sur la ligne doivent être dégagés des aspects ‘réglages’ afin de pouvoir consacrer tout leur temps à leurs manips ». Jacques Joly a conçu, pour la communauté des cristallographes des protéines, des solutions automatisées permettant un fonctionnement 24 heures sur 24, week-end compris, et a introduit depuis 2001 l’utilisation de robots anthropomorphes destinés à accélérer et à fiabiliser les manipulations des échantillons à analyser.
Un robot nommé CATS (Cryogenic Automated Transfer System) a été développé dans ce but. Aujourd’hui commercialisé sous licence CEA/CNRS, il se charge notamment de manipuler les cristaux, depuis le Dewar4 où ils sont congelés jusqu’à leur positionnement dans le faisceau de rayons X.
Outre une innovation technologique à destination des chercheurs, les aptitudes de ce robot sont constamment améliorées grâce au talent d’ingénieur de Jacques Joly.

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ECRIN fait place au Club "ECRIN-Analyse"au sein de la Société Chimique de France

Suite à la fin d'ECRIN en août 2008, les membres du bureau ont décidé d'échapper à cette destruction collective et ont créé au sein de la Société Chimique de France [SCF] un groupe "Analyse en Milieu Industriel".

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La Fondation FINOVI annonce l’attribution d’une enveloppe de 600 k€ pour soutenir les équipes de recherche académique locales

Dans le cadre de son programme d’appel d’offres, le conseil d’administration de la fondation FINOVI réuni en séance le 30 novembre 2009, et présidé par Charles Kleiber, a délibéré sur le quatrième appel d’offres pour le financement de projets de recherche en infectiologie. Les financements sont dédiés à des projets dans le domaine des hépatites virales.

A l’issue du processus de sélection, la fondation FINOVI a décidé d’attribuer une enveloppe de 600k€ pour soutenir les équipes de recherche académiques locales. Cette enveloppe permettra de créer des postes de post-doctorants et viendra amorcer ou compléter le budget de fonctionnement des projets sélectionnés.
Les projets qui seront soutenus sont les projets portés par :

• Christophe COMBET – Institut de Biologie et de Chimie des protéines, UMR5086 CNRS/UCB
  Projet : cou®tesy: COUnter ResisTancE System
  Subvention : 30k€
• Dominique KAISERLIAN – Unité Immunité, Infection et Vaccination, U851 INSERM/UCBL/HCL
  Projet : Role of plasmacytoid dentritic cells in HCV immune evasion
  Subvention : 140k€
• Eve-Isabelle PECHEUR et Florence RUGGIERO - Institut de Biologie et de Chimie des protéines, UMR5086 CNRS/UCB
  Projet : Role of the hepatic microenvironment in the infection of hepatocytes by the hepatitis C virus/: an integrated microscopy approach
  Subvention : 130 k€
• Dimitri LAVILLETTE – Unité de Virologie Humaine, U758 INSERM/ENS
  Projet : Rational design of hepatitis C virus vaccine candidate based on studies of cell entry and its neutralization
  Subvention : 140k€
• Fabien ZOULIM - Unité de physiopathologie moléculaire et nouveaux traitements des hépatites virales, U871 INSERM/UCB
  Projet : Is hepatitis B virus really a stealth virus ? Demonstration of the hepatocyte innate response to hepatitis B virus infection
  Subvention : 160 k€

Ces projets s’inscrivent dans le cadre de la stratégie scientifique de la fondation FINOVI (thématiques prioritaires : hépatites, maladies respiratoires et infections nosocomiales) et répondent aux critères de sélection de la fondation FINOVI, l’Excellence, le thème de l’infectiologie, le caractère novateur, le caractère innovant et la multidisciplinarité.
Avec ce troisième appel d’offres, cela porte à 2 216 000 euros, le montant du soutien financier accordé par la Fondation FINOVI aux équipes de recherche académiques de Lyon et de Grenoble.

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Accord de collaboration entre l'IBS et la société SERVIER

Un accord de collaboration de trois ans a été signé fin septembre 2009 entre la société Servier et le CEA. Par cette collaboration, Servier s’associe à un projet de l’IBS portant sur le développement d’une plateforme de production et de détermination de structure tridimensionnelle de protéines membranaires : PAMPS (Platforms Accelerating Membrane Protein Structures).

Ce programme vise à accélérer considérablement la difficile résolution de structure de protéines membranaires, qui sont les cibles de 70% des médicaments. Cette opération, porteuse de larges retombées pharmacologiques et biotechnologiques potentielles, est co-pilotée par Christine Ebel, Franck Fieschi, Valentin Gordeliy, Eva Pebay-Peyroula et Thierry Vernet.

L’AEPI publie un nouvel argumentaire dans le secteur des biotechnologies

L’objectif est de mettre en avant la complémentarité entre les technologies de l’information et de la communication et les sciences de la vie, un des atouts de Grenoble-Isere. Cette convergence de disciplines permet à Grenoble-Isere de se positionner comme un pôle d’expertise dans les domaines du diagnostic, des nouvelles thérapies et de l’ingénierie pour la santé, trois secteurs porteurs d’avenir.

La publication rassemble les entreprises et laboratoires de recherche dans des projets de R&D ou en phase de développement et de production de nouveaux produits. Pour citer quelques exemples phares :

• Le partenariat entre bioMérieux et le CEA pour le développement de lab-on-chips et de nouveaux outils de diagnostic
• La collaboration entre PX’Therapeutics, BD et le CEA pour le développement de tests cutanés pour la détection de la tuberculose
• Orange Labs et le CHU de Grenoble dans l’exploration de nouveaux outils pour faciliter le maintien à domicile des personnes âgées et handicapées
• Praxim Medivision, TIMC, le CEA-Leti et plusieurs autres entreprises locales pour leurs efforts dans le domaine de la chirurgie assistée par ordinateur et de la médecine augmentée.

Cette publication est l’aboutissement d’un travail de recensement et de classement thématique de tous les acteurs impliqués dans cette convergence de technologies et de tous les projets de R&D financés par des fonds européens ou français, en particulier ceux labellisés par les deux pôles de compétitivité Lyonbiopole et Minalogic.

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I-care : un nouveau cluster Rhône-Alpes au service du « soin innovant »

Avec un chiffre d’affaires mondial de 170 milliards d’euros, les technologies de la santé connaissent une croissance importante (de l’ordre de + 8 à 10 %, chaque année) et de profondes mutations : évolution de la prise en charge médicale (dossier médical, télé-médecine, etc.), mondialisation de l’offre, concentration des acteurs, etc.
Dans ce contexte, la région Rhône-Alpes a impulsé la formation de son dixième cluster économique, destiné à regrouper l’ensemble des acteurs intervenant dans le domaine des technologies médicales. Elles représentent, dans la région, une activité historique et un secteur fortement stratégique. Après un an de réflexion, de maturation et de mise en oeuvre du projet, I-Care est officiellement né…
« L’objectif global du cluster est de promouvoir, à travers la mise en réseau des acteurs, une nouvelle approche du soin : innovant, global, personnalisé », explique Gérald Comtet, animateur du cluster. Si les technologies de la santé recouvrent des activités très variées, elles semblent en effet s’inscrire dans une nouvelle logique, celle du cycle intégré de santé, imbriquant la prévention, le diagnostic, la thérapie et le suivi du patient.

Concrètement, I-Care Rhône-Alpes Cluster va mettre en oeuvre trois objectifs :

• renforcer la compétitivité des entreprises adhérentes, en agissant sur différents leviers : l’international (salons, networking, etc.), le développement commercial, la formation et l’innovation sous toutes ses formes : organisation des structures, ressources humaines, innovation technologique, etc.
• impulser une dynamique nouvelle, en fédérant l’ensemble des acteurs de la santé autour d’une vision et d’une stratégie communes ;
• développer, durablement, les technologies de la santé.

Le cluster interviendra sur plusieurs marchés émergents, créateurs d’emplois, avec un objectif principal : renforcer l’intégration des dispositifs médicaux au cycle de santé. A titre d’exemples, les « solutions de coaching sanitaire » (prévention médicale) ou les dispositifs adaptés au vieillissement de la population et à la perte d’autonomie font partie de ces secteurs porteurs.
« I-care, cela signifie : mettre la technologie au service du soin et contribuer au progrès médical ». Si le cluster est, avant tout, un regroupement de professionnels, sa formation et sa mission nous concernent donc tous…

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Les Trophées des 2èmes Rencontres industriels - Académiques du CLARA
Deux projets à fort potentiels récompensés

Le 20 octobre 2009, à l'occasion de ses 2èmes Rencontres Industriels - Académiques, le Cancéropôle CLARA a décerné deux Trophées, à des projets de recherche académique à fort potentiel de valorisation. Ils ont été attribués à

• Joël Plumas pour ses travaux dans le domaine de l'immunothérapie des mélanomes
• Jens Hasserodt pour le développement d'un agent de contraste intelligent pour l'Imagerie par Résonance Magnétique.

Les deux chercheurs sont à la recherche d'un partenariat industriel. C'est précisément l'objectif des rencontres industriels-académiques organisées par le Cancéropôle CLARA, de favoriser les synergies entre acteurs académiques, cliniques et industriels dans le domaine de l'oncologie. Pour la deuxième année consécutive, elles ont rencontré un vif succès auprès des presque 250 participants. La manifestation s'est déroulée en 2 temps :
1. des entretiens en face à face entre les chercheurs venus promouvoir leur projet d'études et les industriels présents dans une logique de veille technologique,
2. la séance plénière était consacrée au thème « Les partenariats Industriels Académiques en oncologie : intérêts et difficultés ».

Cette manifestation s'est clôturée avec la remise des premiers Trophées des Rencontres du CLARA, destinés à distinguer le potentiel de valorisation des projets académiques soumis à l'occasion de la manifestation. Les lauréats ont été sélectionnés parmi 50 projets soumis au vote des industriels :

• GeniusVac : immunothérapie des mélanomes en utilisant une lignée allogénique de cellules dendritiques plasmacytoîdes - Joêl Plumas, Etablissement français du sang, INSERM, UJF, CNRS, CHU de Grenoble.
• Le développement d'un agent de contraste intelligent pour la visualisation de l'expression génique par IRM in vivo chez l'animal - Jens Hasserodt, ENS Sciences Lyon, CNRS.

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Laboratoire de Spectrométrie physique (SPECTRO CNRS/UJF) :
Des globules rouges en forme de pantoufle : une clé de compréhension des maladies du sang ?

Le laboratoire de Spectrométrie physique (SPECTRO CNRS/UJF), en collaboration avec un laboratoire marocain et une université américaine, vient de mettre en lumière les raisons pour lesquelles les globules rouges prennent une forme asymétrique, dite « en pantoufle », lorsqu’ils traversent les petits vaisseaux sanguins. Savoir pourquoi les globules rouges adoptent une telle forme peut être une clé de compréhension des maladies du sang. Ces travaux ont été publiés en couverture de Physical Review Letter et ont été distingués par la presse scientifique américaine, entre autres.

Le fait que les globules rouges ou hématies prennent une forme asymétrique lors de leurs passages dans les capillaires sanguins intrigue les scientifiques depuis des décennies. Comprendre cette forme dite « en pantoufle » ainsi que le comportement mécanique des hématies peut être primordial dans le diagnostique des maladies du sang. Les chercheurs du laboratoire SPECTRO, et leurs collègues marocain et américain, ont développé un modèle mécanique relativement simple qui a abouti à une simulation numérique novatrice de la forme des globules rouges, permettant de mieux en comprendre les interactions avec l’ensemble du sang.

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Inauguration de la plate-forme grenobloise du CLARA

La plate-forme grenobloise du Cancéropôle Lyon Auvergne Rhône-Alpes (CLARA), portée par le CHU de Grenoble, l'université Joseph Fourier et l'Inserm, a été officiellement inaugurée le 29 octobre dernier par Thierry Philip, Vice-président de la Région Rhône-Alpes, et par Michel Destot, Député-maire de Grenoble, Président du conseil d'administration du CHU, en présence de Geneviève Fioraso, Députée de l'Isère, Jean Debeaupuis, Directeur général du CHU, Bernard Sèle, Vice-président Santé de l'UJF, et de Peter Pauwels, Délégué général du CLARA.

Située sur le campus Santé, la plate-forme grenobloise du CLARA a pour finalité d'améliorer la prise en charge des malades porteurs de cancer, grâce au transfert des connaissances jusqu'au lit du malade. Elle regroupe le CHU de Grenoble, avec un recrutement important de malades porteurs de pathologies malignes, la Faculté de Médecine de l'UJF, les deux centres de recherche Inserm/UJF, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN) et Institut Albert Bonniot (IAB), ainsi que les laboratoires CNRS/UJF en microbiologie et ingénierie pour la santé.
350 chercheurs, médecins et personnels techniques, des industriels ou des start-up sont réunis autour de cette plate-forme qui donne à Grenoble et au campus Santé une véritable lisibilité internationale en protéomique, nanotechnologies et imagerie fonctionnelle appliquées aux problèmes de santé, en particulier à la cancérologie.
La plate-forme grenobloise du CLARA, dont le CHU de Grenoble, l'UJF et l'Inserm sont les établissements maîtres d'ouvrage, a bénéficié pour les années 2004-2007 d'un financement total de la Région Rhône-Alpes de 4,5 M€. En synergie avec le CLARA, le CHU et l'UJF (pour son propre compte et pour le compte de l'Inserm) ont mené à bien l'acquisition des équipements financés dans le cadre du programme 2004-2007 et ont porté la politique scientifique sous jacente à ce programme.

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Une équipe de l’IBS reçoit le label « Equipe FRM 2009 »

L’équipe d’Andrea Dessen a reçu le label « Equipe FRM 2009 » de la Fondation pour la Recherche Medicale dans le cadre du programme « Espoirs de la recherche », pour ses travaux sur "Le mécanisme de biosynthèse de la paroi cellulaire des bactéries, une cible pour le développement de nouveaux antibiotiques".

Le programme « Espoirs de la recherche » accorde des financements récurrents sur trois ans à une vingtaine d’équipes de recherches labellisées « Équipes FRM », sélectionnées sur la base de projets particulièrement innovants porteur d’espoir de progrès dans le domaine de la santé.